新疆果業集團有限公司成立于1984年6月，經自治區黨委、人民政府研究決定，自2024年7月31日起新疆果業集團有限公司正式成為新疆商貿物流（集團）有限公司二級子公司。經過四十年的發展，公司形成了以特色林果產業為核心，的業務發展格局。

       2019年11月25日，入選第四批國家林業重點龍頭企業名單。

       2019年12月16日，入選“農業產業化國家重點龍頭企業名單”。

       2020年1月7日，入選2019年全國農產品加工業100強企業名單，綜合排名第63。

       2020年12月，被中華全國供銷合作總社授予“全國供銷合作社系統抗擊新冠肺炎疫情先進集體”稱號。

       2021年2月25日，被黨中央、國務院授予“全國脫貧攻堅先進集體”稱號。

       2021年4月25日，入選中國農業產業化龍頭企業協會發布的“2020年農業產業化龍頭企業百強”名單，位列第51名。